Bionieuws

Plant & Dier

Varengenoom uit Utrechts slootje

De twee varens waarvan nu het genoom is bepaald: grote kroosvaren (achter) en Aziatische vlotvaren (voor). Foto: Laura Dijkhuizen, Universiteit Utrecht

Het is een primeur: het eerste complete genoom van een varen is gesequenst. Met een gedeelde eerste plaats, want op 2 juli publiceerde Nature Plants de genomen van de grote kroosvaren (Azolla filuculoides) én de Aziatische vlotvaren (Salvinia cucullata). Van de kroosvaren is het gesequenste exemplaar door Utrechtse biologen uit een sloot gevist bij stadion Galgenwaard. Het gaat om kleine genomen – van respectievelijk 750 en 260 miljoen basenparen – die dankzij crowdfunding en medewerking van het Beijing Genomics Institute in vier jaar in kaart zijn gebracht. Uit de analyses blijkt dat Azolla twee complete genoomduplicaties heeft doorgemaakt en specifieke genen bezit die de unieke symbiose met de stifkstofbindende cyanobacterie Nostoc azollae mogelijk maakt.

Over deze publicatie verscheen ook een News & Views in Nature van 2 juli.

Dit bericht verscheen in Bionieuws 12 van 7 juli 2018.